Anomaly 2 продолжает историю об инопланетном вторжении, начатом в Anomaly: Warzone Earth. Машины-пришельцы обосновались на Земле настолько прочно, что дальнейшее существование людей оказалось под большим вопросом. Объединившись в конвои, остаткам человеческой расы, страдающим от нехватки еды и боеприпасов, предстоит бороздить просторы снежной тундры, застроенной пришельческими "башнями".