Действие игры происходит в 2047 году, а вам предстоит выступить в роли Пророка. Он возвращается в Нью-Йорк, где узнает о том, что город закрыт куполом Nanodome, который был создан корпорацией C.E.L.L.

В Big Game Hunter: 2004 Season есть и полноценная кампания, в которой необходимо выполнять определенные задания, зарабатывать деньги, покупать оборудование и постепенно открывать доступ к новым картам.