Весна 1945 года. Советские войска штурмуют Берлин. Единственная надежда фашистов на спасение - работа по созданию атомной бомбы. В роли снайпера-диверсанта вам необходимо выполнить очень важное задание. Замаскировавшись под немецкого солдата, вы должны проникнуть на секретные объекты врага и, используя свои шпионские и снайперские способности, сорвать коварные планы врага.

Действия игры начинаются на немецком линкоре Тирпиц. Агент США Би Джей Блажкович совершает диверсию на нацистском линейном корабле. Блажковичу почти удаётся добежать до самолёта, но он попадает в окружение фрицев. На Тирпице агент обнаружил интересный медальон. Когда фашисты открыли огонь, артефакт защитил Би Джея от пуль, а затем уничтожил противников. В последний момент Блажковичу удаётся залесть в самолёт и улететь. Тирпиц ушёл на дно.

Действия игры происходят в 1943 году, когда Третий Рейх хотел вернуть потерянную инициативу в войне с помощью сверхестественных сил. США начинает отправлять своих шпионов, с целью разведки планов фашистов, но связь с ними прерывается. Вы начинаете игру в роли агента Билли Блашковича. Вас взяли в плен и отправили в камеру замка Вольфенштейн.

Продолжение истории о полувампирше по имени Рейн. В первой части игры она не нацистским учёным призвать в помощь Третьему Рейху потусторонние силы. Упустив шанс лично прикончить своего отца - Кейгана, который оказался союзником фашистов, Рейн в последующие 60 лет охотилась и убивала его детей. Оставшиеся в живых вампиры создали Культ Кейгана и поклялись выполнить его волю.

Девушка Рейн родилась дампиром, т.е. вампиром полукровкой. Ей необходимо отомстить вампирам за смерть своих родителей. Рыжеволосая дампирша вступает в организацию "Бримстоун", которая должна не дать фашистким учёным призвать сверхъестественные силы на помощь Третьему Рейху.